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バイオテクノロジー関連の推薦リンク集−データベース・リソースセンター−

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データベース・リソースセンター
分類 名称・URL コメント
動物
細胞
JCRB Cell Bank

http://cellbank.nibio.go.jp/
wwwjcrbj.htm
医薬基盤研究所 生物資源研究部が運営するセルバンク。
細胞株の情報検索、寄託、保存された細胞の品質管理を行うとともに、保有している細胞を有償で分譲している。
動物
細胞
理化学研究所バイオリソースセンター
セルバンク

http://www.brc.riken.jp/
lab/cell/hms/
細胞株の情報検索、寄託、保存された動物由来細胞株の他に研究用ヒト幹細胞の細胞の品質管理を行うとともに、 保有している細胞を有償で分譲している。
理化学研究所バイオリソースセンターが運営。
動物
細胞
ATCC

http://www.atcc.org/
ATCC(American Tyep Culture Collection)が運営。
データベース構築の他に、動物細胞とその派生物を譲渡している。
動物
細胞
ヒューマンサイエンス研究資源バンク

http://www.jhsf.or.jp/index_b.html
国立医薬品食品衛生研究所、国立感染症研究所で収集、標準化し、品質管理を行った細胞、遺伝子等を広く産学官の研究者に 有償で分譲。
従来行ってきた高等動物の細胞・遺伝子に加え、ヒト組織、マウス胚等の研究資源も取り扱う。
動物
細胞
東北大学加齢医学研究所
医用細胞資源センター

http://www.idac.tohoku.ac.jp/dep/ccr/
細胞に特化した細胞バンク。
日本で維持されている可移植性腫瘍株一覧表が掲載されている。
DNA JCRB遺伝子バンク

http://genebank.nibio.go.jp/gbank/
医薬基盤研究所 生物資源研究部が運営する遺伝子バンク。
主にヒト・霊長類のゲノム情報を利用した疾病要因の解明と創薬研究の基盤となる遺伝子資源の開発・供給を行っている。
DNA RIKEN BRC DNA BANK

http://www.brc.riken.jp/lab/dna/ja/
各種クローン、ベクター、ウイルスの収集と保存、データベース公開、研究者への提供を行っている。
理化学研究所バイオリソースセンターが運営。
DNA NIAS DNA Bank

http://www.dna.affrc.go.jp/jp/
農業生物全般(植物、動物等)のDNA、遺伝子関連研究に関わる物質及び情報の収集、 管理及び提供を行うことにより試験研究を支援することを目的としている。
農業生物資源研究所が運営。
マウス 理化学研究所バイオリソースセンター
実験動物開発室

http://www.brc.riken.jp/lab/animal/
近交系、野生由来系統、突然変異系統、先進的な遺伝子操作系統マウスの収集・保存を行っている。 検索機能を利用したマウスの分譲も可能。理化学研究所バイオリソースセンターが運営。
マウス 理化学研究所
ゲノム科学総合研究センター

http://www.gsc.riken.jp/Mouse/
ENUを用いて作製された突然変異マウスの保存と、そこから得られる遺伝情報を解析している。 突然変異マウスの検索と、有償での譲渡が可能。理化学研究所ゲノム科学総合研究センターが運営。
マウス The Jackson Laboratory

http://jaxmice.jax.org/models/
英語サイト。研究用マウス、疾患モデルマウスを広く扱っている。検索機能も充実しており、ラインナップも充実。
植物
一般
理化学研究所バイオリソースセンター
実験植物開発室

http://www.brc.riken.jp/lab/epd/catalog/
plantm.shtml
実験植物開発室では、植物種子、植物遺伝子材料、及び植物培養細胞の収集、保存、検査、提供業務を行うとともに、 生物遺伝資源を新たに作成し、また有効利用するための技術開発を遂行している。理化学研究所バイオリソースセンターが運営。
イネ イネゲノムリソースセンター

http://www.rgrc.dna.affrc.go.jp/jp/
独自に開発したイネ突然変異株やcDNAクローンの作製と保存をおこない、研究者に有償で提供している。
農業生物資源研究所が運営。
イネ Oryzabase

http://shigen.lab.nig.ac.jp/rice/
oryzabase/top/top.jsp
国立遺伝学研究所 系統生物研究センターが運営。
Oryzabaseは、以下の項目から構成される。
(1)イネ系統情報、(2)突然変異体情報
(3)染色体マップ情報、(4)遺伝子情報
(5)文献情報(遺伝子名に関連した文献が中心)
(6)イネ学の基礎、(7)関連サイトリンク集
また、遺伝資源の分譲も行っている。
微生物 理化学研究所バイオリソースセンター
微生物材料開発室

http://www.jcm.riken.jp/JCM/
JCM_Home_J.html
研究、教育、産業など、ライフサイエンスの各分野で必要とされる微生物株を広く収集、 検定、保存し、研究機関などに提供している。
理化学研究所バイオリソースセンターが運営。
微生物 製品評価技術基盤機構
生物遺伝資源部門

http://www.nbrc.nite.go.jp/
独自に収集した有用微生物、実験微生物の他に、寄託されたサンプルの保存を行い広く研究者に分譲している。
微生物の他にcDNAクローンも分譲している。
製品評価技術基盤機構 生物遺伝資源部門が運営。
ラット NBRP Rat

http://www.anim.med.kyoto-u.ac.jp/nbr/
ラット系統の収集、胚・配偶子の保存を行い、研究者に有償で提供している。 また、ラット系統についてのデータベース構築とそれらの公開もしている。
京都大学大学院 医学研究科附属動物実験施設が運営。
アフリカ
ツメガエル
NBRP Xenopus

http://shigen.lab.nig.ac.jp/xenopus/top.jsp
トロピカリスの収集、保存、提供およびESTクローンの提供、データベース公開をしている。
広島大学大学院 理学研究科附属 両生類研究施設が運営。
メダカ NBRP Medaka

http://shigen.lab.nig.ac.jp/medaka/
メダカ系統の収集・保存・提供を行うとともに、保存技術の改良と普及を図り、 系統の特性などに関する情報を提供。
名古屋大学 生物機能開発利用研究センターが運営。
ショウジョウバエ Flystock

http://218.44.182.89/%7Eflystock/html/
ショウジョウバエ系統の統合検索システム。 現在のところ、保存されている系統を一括して検索ができるようにしたデータベースです。
検索には遺伝子型、細胞学的位置、種名などの項目が利用可能で、検索後、各系統維持機関への提供依頼もできます。
京都工芸繊維大学 ショウジョウバエ 遺伝資源センターが運営。
ゼブラ
フィッシュ
ZEBRA FISH
-National Bio Resource Project

http://shigen.lab.nig.ac.jp/zebra/
我が国における有用なモデル実験脊椎動物の供給体制を整備するため、 ゼブラフィッシュの収集・保存・提供等を行っている。
理化学研究所 脳科学総合研究センターが運営。
線虫 NBRP 線虫

http://shigen.lab.nig.ac.jp/
c.elegans/index.jsp?lang=japanese
バイオインフォマティクスによる線虫の遺伝子構造を基礎に線虫変異体を逆遺伝学的に収集・保存・提供を行うことを目的としている。
東京女子医科大学医学部が運営。
カイコ SilkwormBase

http://www.shigen.nig.ac.jp/silkwormbase/
我が国固有の遺伝資源であるカイコの、系統収集と保存、突然変異体の作製と提供、データベース公開を行っている。
九州大学大学院農学研究院 遺伝子資源開発研究センターが運営。
オオムギ Barley

http://www.shigen.nig.ac.jp/barley/
独自に収集,開発したオオムギ系統,BACライブラリー,cDNAクローンの保存を行っており、 これらのリソースを国内外の研究者に提供し,オオムギおよび近縁の植物のゲノムや遺伝子の解析, 新しい品種の開発に寄与。
岡山大学 資源生物科学研究所が運営。
コムギ KOMUGI

http://shigen.lab.nig.ac.jp/
wheat/komugi/
top/top.jsp
コムギ(Triticumと関連種Aegilops)の遺伝資源の収集と保存および分譲、 またゲノム関連情報として遺伝子記号のカタログ情報、ESTクローンおよび遺伝子配列情報なども掲載。
京都大学大学院農学研究科が運営。
広義キク属 Chrysanthemum

http://www.shigen.nig.ac.jp/
chrysanthemum/index.jsp
?lang=japanese
広義キク属を対象として、当施設の既存系統の保存及び提供体制の充実、 遺伝的多様性の収集、新規系統の開発や系統の関連情報の整備等を目的としている。
広島大学大学院理学研究科附属 植物遺伝子保管実験施設が運営。
藻類 Algae

http://shigen.lab.nig.ac.jp/
algae/top.jsp
バイオリソースとして魅力的な研究材料となりうる藻類の体系的な収集、効率的な保存、株と情報の一元的管理と 提供体制の整備を進めている。更に共通フォーマットによる株情報の整備とデータベースの構築・公開による迅速 かつ効率的な株情報の提供も行っている。
国立環境研究所 生物圏環境研究領域が運営。
ミヤコ
グサ
ダイズ
Legume Base

http://shigen.lab.nig.ac.jp/
legume/legumebase/
index.jsp?language=ja
野生の多年生マメ科植物で、ゲノムサイズが小さく、ライフサイクルが短いなどの特徴からダイズ等の マメ科の作物にとってモデル植物となるミヤコグサの系統保存と収集、提供を行っている。
宮崎大学農学部生物 環境科学科が運営。
大腸菌 NBRP E.coli Strain

http://shigen.lab.nig.ac.jp/
ecoli/strain/
top/top.jsp
実験生物として極めて高い重要性を持つ大腸菌の系統保存、遺伝子情報収集と解析を行っており、得られた系統や 情報を提供している。
国立遺伝学研究所 系統生物研究センターが運営。
酵母 NBRP 酵母

http://yeast.lab.nig.ac.jp/nig/
醸造産業の担い手として人類にとってなくてはならない微生物であり、生命科学領域でモデル生物と して重要な役割を果たしている酵母の、遺伝資源の収集、保存、提供を行っている。
大阪市立大学 理学研究科が運営。
病原
微生物
(細菌)
(真菌)
(原虫)
NBRP 病原微生物

http://wdcm.nig.ac.jp/
byogen/index.html
病原微生物遺伝資源の収集、保存、提供体制を構築することを目的とする。 また、目覚しい勢いで増えているゲノム解析株について、積極的に収集、保存し、新しい情報を付加し 高品質化した世界的に信頼されるリソースの提供体制の確立を目指している。
千葉大学 真菌医学研究センターが運営。
菌類 FGSC

http://www.fgsc.net/
Missouri University内のFGSC(Fungal Genetics Stock Center)が運営。
データベース公開の他に、菌株の譲渡も行っている。
シロイヌ
ナズナ
TAIR

http://www.arabidopsis.org/
シロイヌナズナの系統とDNAの分譲を行っている。
またシロイヌナズナに関するゲノム情報、文献情報、プロトコル集などの情報も充実している。




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