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バイオテクノロジー関連の推薦リンク集−データベース−

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データベース
分類 名称・URL 説明
総合 日本DNAデータバンク

http://www.ddbj.nig.ac.jp/
Welcome-j.html
DDBJ(DNA Data Bank of Japan)、欧州のEBI/EMBL及び米国のNCBI/GenBankとの密接な連携のもと、「DDBJ/EMBL/GenBank国際塩基配列データベース」を構築している三大国際DNAデータバンクのひとつ。
国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ研究センター内にて運営。
総合 EMBL-EBI

http://www.ebi.ac.uk/embl/
EBI/EMBL(European Molecular Biology Laboratory)、日本のDDBJ及び米国のNCBI/GenBankとの密接な連携のもと、「DDBJ/EMBL/GenBank国際塩基配列データベース」を構築している三大国際DNAデータバンクのひとつ。
総合 GenBank-NCBI

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
NCBI/GenBank(National Center for Biotechnology Information)、日本のDDBJ及び欧州のEBI/EMBLとの密接な連携のもと、「DDBJ/EMBL/GenBank国際塩基配列データベース」を構築している三大国際DNAデータバンクのひとつ。
総合 GenomeNet

http://www.genome.jp/
ゲノム情報を基盤とした新しい生命科学研究を推進するために、 京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンターが提供するインターネットサービス。
DNA Candida Genome Database

http://www.candidagenome.org/
NIH(National Institutes of Health)内の研究室が運営している酵母ゲノムデータベースが元になっているサイト。
DNA TIGR

http://www.tigr.org/
植物、微生物、菌類のゲノムデータベースから遺伝子名、配列、ローカスから検索して目的の情報を得ることが出来る。
TIGR(The Institute for Genomic Research)が運営する英語サイト。
DNA GOLD

http://www.genomesonline.org/
原核、真核生物のカテゴリで分類されている。NCBI、TIGR他のデータベースともリンクしているので情報量は多い。
GOLD(Genomes OnLine Database)が運営する英語サイト。
蛋白質 日本蛋白質構造データバンク

http://www.pdbj.org/index_j.html
PDBj(Protein Data Bank Japan)、PDBにおけるデータ検索、データ登録が行える。
大阪大学 蛋白質研究所が運営。
蛋白質 Swiss-Prot

http://tw.expasy.org/
sprot/sprot-top.html
タンパク質のアミノ酸配列、ドメイン検索、修飾部位などの様々な情報を統合したデータベース。
蛋白質 ExPASy

http://br.expasy.org/
プロテオミクスに関するサイト。
タンパク質データベースの提供の他に、配列解析、構造解析などの多数の解析ツールを提供している。
SIB(Swiss Institute of Bioinformatics)が運営する英語サイト。
制限
酵素
REBASE

http://rebase.neb.com/
rebase/rebase.html
NEBが運営する制限酵素検索サイト。制限酵素の検索の他にキーワード検索による論文照会も可能。
データ
登録
SAKURA

http://sakura.ddbj.nig.ac.jp/
Welcome-j.html
DDBJが運用している WWW 経由の塩基配列データ登録システム。
塩基配列と翻訳アミノ酸配列、その生物学的な機能と特徴、参考文献と登録者情報、氏名と所属を対話形式で入力し登録することが可能。
レクチン Lectines Database

http://webenligne.cermav.cnrs.fr/
lectines/
レクチン専門のデータベース。
動物、植物、微生物様々な生物のレクチンについて、独自のデータベースの他にMedline、 PDBのデータベースから情報を得ることが出来る。英語サイト。




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