発現解析を発展させる技術！（マクロアレイ編）（1／1）

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発現解析を発展させる技術！（マクロアレイ編）（１／１ page）

前項で解説したように、マクロアレイは少量の遺伝子群に対して、マイクロアレイと同じように網羅的に発現解析することが出来る実験手法です。手法とともに製品との関連を見ていきます。

マクロアレイのTOPIX
・マクロアレイ原理
・メンブレン
・マクロアレイヤー
・マクロアレイリーダー

マクロアレイ

マイクロアレイがガラス・プラスティック基盤上にプローブをスポットするのに対して、マクロアレイはハイブリダイゼーション用メンブラン上にプローブをスポットします。サンプルは放射線同位体か蛍光標識して、メンブレンイメージャーなどで解析を行います。その他の研究原理、目的に関してはほぼ同じなのであえて説明は避けます。

ただ、マイクロアレイと異なり比較的小規模でアレイを作製することが出来る点や、メンブレンイメージャーで解析できるため、小数遺伝子（数十～数百）でのアレイ解析、専用機器が無い状況でのアレイ解析が出来る点がメリットになります。

反面、メンブラン上のスポットコントロールは難しく、マイクロアレイと比較して誤差が発生しやすくなります。また、プローブ溶液がメンブレンに拡散しながら染み込むためプローブ密度が低下し、それ故に標識密度が下がるのでS/N比についてもマイクロアレイに劣ってしまいます。これらの特徴を把握し、実験目的と照らし合わせながら利用してください。

マクロアレイは、前述の通り比較的小規模でアレイ作製・解析が出来る実験方法で、特別専用機器を購入しなくても良い点がメリットです。とはいえ、マクロアレイにも専用の試薬・機器が用意されています。専用品は実験精度の向上、各種コストの低減を目的として用意されていますので、研究者への利便性向上のためにも種類は少ないですが以下に簡単に紹介します。

メンブレン

通常の核酸ハイブリダイゼーション用ナイロンメンブランを使用します。

マクロアレイヤー

マクロアレイの場合、プローブやサンプルの量に余裕がある場合には、マイクロピペッターなどを用いた手作業でアレイを作製することも出来ますが、やはり精度の点では機械に遠く及びません。そこで、マクロアレイを作製するための専用機器として、マクロアレイヤーが存在します。

マクロアレイヤーの目的はマイクロアレイヤーと同様ですが、スポット対象がメンブランのためスポット方式がノズルタイプになります（ピンタイプだとスポット定量性が保てないため）。

機器として注目する項目も、マイクロアレイヤーと同様にスポット精度、スピードなどがあります。メンテナンスに関しても、ノズルタイプのアレイヤーと同様です。

マイクロアレイヤーはエムエス機器などから販売されています。【（株）は略】

マクロアレイリーダー
マクロアレイはメンブラン上の蛍光・化学発光/放射線標識スポットを検出することから、これらのシグナルを検出できる高精度のメンブレンイメージャーに専用ソフトウェアを組み合わせることで、場合によっては既にお持ちのメンブレンイメージャーにて解析することが出来ます。
イメージャーは今後の特集でも取り扱う予定です。

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