高速・高純度サンプルの回収を行う装置（核酸、タンパク質）（４／５）

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◆特集◆　高速・高純度サンプルの回収を行う装置（核酸、タンパク質）（４／５）

TOPIX
  ○核酸（DNA・RNA）を回収する装置
      ・遠心分離・アルコール沈殿タイプ
      ・フィルター濾過タイプ
      ・磁性ビーズ吸着タイプ
  ○タンパク質を回収する装置
  ○試薬
  ○関連受託サービス

磁性ビーズ吸着タイプ

このタイプの場合、磁性ビーズの分子と核酸とを結合させる必要があるため、分子間の結合を阻害する図１の様な実験手法を用いることは少ないです。

磁性ビーズ吸着タイプでは核酸分解酵素を阻害する専用バッファーに細胞を懸濁し、作成した変性タンパク質・核酸混合液の中に、回収したい核酸のみに結合するプローブを持つ磁性ビーズを添加します。磁性ビーズと核酸とが十分に結合した後、これらのビーズを強力な磁石を用いて回収します。回収したビーズを洗浄試薬に懸濁した後、同じく磁石を用いて回収します。最後に専用バッファーにビーズを懸濁し、ビーズと核酸とを分離させ、ビーズのみを回収します。（図４）

専用バッファーで作成したタンパク質・核酸混合液中に、核酸と結合するよう設計された磁性ビーズを混合します。磁性ビーズと核酸とが十分に反応した後、磁石（電磁石）を用いてビーズを回収します。回収したビーズは核酸の純度を高めるため何度か洗浄した後、ビーズと核酸とを分離させるバッファーに溶解して核酸を回収します。磁性ビーズに配置するプローブを変えることで、目的の配列を持つ核酸を選択的に回収することが出来ます。

磁性ビーズを用いた核酸回収・精製法は、マニュアルで行う手法としては比較的少数派になります。ただし、核酸の中から特定の成分を選択的に回収する場合（例えばmRNAのみの回収・特定のシーケンスの回収）にはとても優れた方法として知られ、現在販売されているキットもこの使用例が多いです。

磁性ビーズ吸着タイプの装置は、
ロシュ・ダイアグノスティックス、プレシジョン・システム・サイエンス、キアゲン
サーモエレクトロン、タカラバイオ、バイオテック

【順不同/（株）は略】

などから販売されています。

自動化システムの場合は、先ほど述べたように専用バッファーへの細胞の溶解という１ステップのあとダイレクトに目的の核酸を回収できるので、迅速にサンプルを回収することが出来ます。ただし磁性ビーズ試薬はまだまだコストが高く、しかも使い捨てにすることが多いのでランニングコストがかさむ傾向にあります。

以上の点をまとめるとこれらの機器の特徴と効率的な使用法をまとめることが出来ます。

◇遠心分離・アルコール沈殿タイプ

特長
全体的に機器コスト・ランニングコストが低い傾向がある。サンプル種の変更・スケールアップにも対応しやすい。精製純度は普通レベル。

効率的な使用例
大量のサンプルをローコストで処理する場合に適している。例として実験スピードにはそれほどこだわらず（例えばオーバーナイトで処理する）、サンプルのスクリーニング処理の前段階として使用するなど。

◇フィルター濾過タイプ

特長
機器コストは普通だが、試薬コストは若干高くなる場合が多い。純度の高いサンプルを得ることが出来るが、サンプル種の変更・スケールアップの場合には専用試薬を変える必要がある。

効率的な使用例
小～中程度のサンプルを処理する場合に適している。例としては精製度の高さを生かしてクローニング・シーケンスサンプルの作成を行う場合など、ダイレクトに使用できるので効率が良い。

◇磁性ビーズ吸着タイプ

特長
機器コスト・試薬コストが高い。純度の高いサンプルを得ることが出来、特にmRNAの選択的な回収などに威力を発揮する。フィルタータイプと同様、サンプル種の変更・スケールアップの場合に試薬セットを交換する必要がある。

効率的な使用例
サンプル数にかかわらず高純度のサンプルや目的の配列のみを回収する場合に最適である。cDNAクローニングのためのmRNAの回収や、生物種・細胞種の異なる混合サンプルからの目的組織・細胞の遺伝子配列の回収に使用するなど。

次は、タンパク質を回収する装置を見ていきます。

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